甘蔗花叶病毒主要为害叶片，尤以新叶基部症状最为明显。一般出现黄绿相间不规则的嵌纹、条斑或斑驳，长短大小不一，布满叶片。有时病斑褪绿很明显，形成黄白斑，偶现坏疽之红点。病株叶色较健株浅，生长也缓慢。

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美国Agdia公司是植物病害诊断试剂的生产商，其病毒检测试剂盒可达150余种，另外还有细菌、真菌以及转基因检测试剂盒。产品有各种规格（96孔、288孔、480孔、500孔、1000孔、5000孔），可以适合不同实验室